Предлагаем вашему вниманию перевод опубликованной в Cell статьи, в которой рассмотрен один из путей развития пищевой промышленности — масштабный переход на новые микробные пищевые продукты. Пугает ли вас такой сценарий? Или и вы ждёте появления на обеденном столе новых «приятных и восхитительных вкусов и текстур»?
Авторы публикации — Леони Ян (Leonie J. Jahn), Ваю М. Рекдал (Vayu M. Rekdal) и Мортен О. А. Зоммер (Morten O. A. Sommer), биологи из Датского технического университета (дат. Danmarks Tekniske Universitet, DTU).
Аннотация
Нынешняя система питания оказывает негативное влияние на здоровье планеты и человека. Крайне необходим переход к устойчивой и справедливой продовольственной системе. Одним из инструментов реализации этого перехода, по-видимому, являются микроорганизмы, так как они способны, почти не воздействуя на окружающую среду, синтезировать вкусные и полезные пищевые продукты. В нашем обзоре рассмотрены традиционные и современные подходы к производству таких продуктов, как ферментированные продукты, микробная биомасса и пищевые ингредиенты, получаемые в результате микробной ферментации. Мы рассуждаем о том, как будущие достижения в наукоёмкой ферментации, синтетической биологии и стабильном обеспечении сырьём позволят создать новое поколение микробных пищевых продуктов, т. е. пищевых продуктов микробного синтеза, способных влиять на нашу систему питания — на её устойчивость, гибкость и полезность для здоровья.
Введение
Наша система питания ставит перед нами множество проблем, так как в настоящее время она крайне неустойчива, расточительна и в целом нездорова1. Производство продуктов питания является наиболее важным фактором изменения климата и утраты биоразнообразия2. Ущерб окружающей среде усугубляется неэффективностью продовольственной системы, что приводит к огромному количеству отходов3. В то же время одна значительная часть населения планеты недоедает4, а другая страдает от неинфекционных заболеваний, частично вызываемых потреблением подвергшихся глубокой переработке, высококалорийных продуктов питания5. Эти проблемы требуют от учёных, представляющих разные направления и виды науки, немедленных разномасштабных действий.
Микроорганизмы станут ключевыми ингредиентами рецепта позитивных перемен.
Микроорганизмы уже играют центральную, но часто упускаемую из виду роль в нашей продовольственной системе, начиная с производства и обработки пищи и кончая процессом потребления. Сельское хозяйство зависит от почвенного микробного биоразнообразия и растительных микробиомов, которые влияют на опыление, здоровье, урожайность, питательность и вкус растений6,7,8. После сбора урожая сельскохозяйственные продукты часто подвергаются дополнительной обработке, и одним из её старейших и наиболее распространённых вариантов является микробиологическая ферментация9. Полученные таким образом продукты потребляются, и в пищеварительном тракте, где обитают сотни различных видов микроорганизмов, происходит метаболизм. Рацион человека существенно влияет на микробные сообщества в кишечнике, формирует их, что, в свою очередь, влияет на пищевой статус человека и общее состояние его здоровья10.
В системе питания микроорганизмы, помимо указанных основных функций, способны выполнять и другие. Мы можем использовать их для производства новых продуктов питания, чтобы смягчить кризис здоровья человека и всей планеты11. Согласно данным двух недавних исследований, мы ослабим потенциал глобального потепления на 80%, а также сократим землепользование и водопользование, если удастся заменить все продукты животного происхождения на новые продукты питания, в частности на микробные белки и молоко, получаемое в результате прецизионной ферментации11; мы сократим на 50% обезлесение и связанные с землепользованием выбросы в атмосферу углерода, если 20% мяса жвачных животных будет заменено микробным белком, который выращивается на потоках отходов производства сахарного тростника12. Микробиологически произведённые продукты питания, определяемые здесь как «микробные пищевые продукты», создаются с помощью научно обоснованной микробной ферментации, микробной биомассы или пищевых ингредиентов, получаемых на фабриках микробных клеток (Рис. 1). Хотя в настоящее время микробное производство пищевых продуктов осуществляется как в кустарных, так и в промышленных масштабах, для реализации всего потенциала микробных пищевых продуктов следующего поколения потребуются инновации в нескольких областях. Эти области требуют 1 понимать и использовать микробное биоразнообразие для производства продуктов питания, чтобы улучшить здоровье человека и всей планеты; 2 применять наукоёмкую ферментацию и научные инструменты, включая генную инженерию, для улучшения производства микробных пищевых продуктов и 3 повышать эффективность продовольственной системы за счёт использования в качестве субстратов для создания микробных пищевых продуктов отходов и атмосферного углекислого газа.
Использование микробного биоразнообразия для улучшения здоровья человека и всей планеты
Микробиомы ферментированной пищи для устойчивого питания и здоровья
Ферментированную пищу, старейшую и традиционнейшую версию микробных пищевых продуктов, можно определить как твёрдую и жидкую пищу, производимую посредством контролируемой микробной трансформации ингредиентов13. Человечество использует микроорганизмы для создания пищи в течение тысячелетий14,15,16; по-видимому, с самого раннего этапа своего развития17, на что указывает наблюдавшееся учёными намеренное ферментирование фруктов обезьянами18. Кроме того, давнюю связь между людьми и ферментированной пищей подтверждают генетические данные19. Например, в отличие от других млекопитающих, у людей имеется дополнительная копия рецептора гидроксикарбоновой кислоты 3 (HCA3). Эта копия взаимодействует с D-фенилмолочной кислотой — метаболитом, который обычно вырабатывается молочнокислыми бактериями и присутствует в ферментированных продуктах20. Сегодня такие продукты широко используются во всём мире и составляют около одной трети потребляемых продуктов21.
Увеличение доли ферментированных продуктов в нашем рационе способствует оздоровлению планеты и человека сразу в нескольких аспектах. Рассмотрим эти аспекты.
Во-первых, ферментацию можно использовать для того, чтобы продукты питания лучше сохранялись и были более безопасными при потреблении. Условия ферментации и микробная активность снижают количество клеток патогенных организмов, например, за счёт изменения pH22, конкуренции в потреблении питательных веществ23 или производства консервантов с противомикробной или противогрибковой активностью24,25.
Вследствие этого ферментированные пищевые продукты зачастую безопаснее для потребления, чем их неферментированные аналоги26.
Кроме того, увеличенный срок хранения многих ферментированных пищевых продуктов позволяет сократить потери продуктов питания во всех звеньях производственно-сбытовой цепи, начиная с полей и заканчивая магазинными и домашними полками, в результате чего растёт эффективность производства продуктов питания и улучшается использование пищевых ресурсов.
Во-вторых, микробная активность в процессе ферментации является мощным инструментом для создания de novo восхитительных вкусов и текстур. Разнообразные текстуры сыра, вкус шоколада, соевого соуса, вина и многих других твёрдых и жидких продуктов представляют собой результат микробной ферментации27. Этот потенциал можно использовать для повышения привлекательности новых полезных для здоровья и экологически чистых продуктов питания. Поскольку органолептические свойства пищи определяют производство новых продуктов и выбор уже имеющихся28, потенциал ферментации в плане создания приятных и восхитительных вкусов и текстур будет иметь огромное значение для изменения пищевых привычек в сторону более устойчивых вариантов.
В-третьих, в процессе ферментации происходит изменение питательного состава пищевых продуктов. Ингредиенты, содержащие такие антипитательные вещества, как фитиновая и щавелевая кислоты29, которые хелируют ионы металлов и тем самым снижают питательный потенциал, содержание клетчатки30, а в некоторых случаях даже токсины31, можно трансформировать путём ферментации в безопасную вкусную пищу. Например, маниока (Manihot esculenta), крахмалистые клубни которой могут расти на самых разных видах почвы, во многих южных регионах планеты является основным продуктом питания, хотя в её корнях и листьях высоко содержание цианидов32. Обычно эти корни и листья ферментируют, в результате чего содержание цианидов снижается до уровней безопасного потребления33. Аналогичным образом ферментация может превращать в пищевые продукты растения и продукты, ранее пребывавшие за рамками системы питания, способствуя сокращению пищевых отходов и адаптации человечества к изменяющимся климатическим условиям путём создания новых сельскохозяйственных культур. Помимо улучшения здоровья планеты, изменения в составе питательных веществ могут служить и улучшению здоровья человека, так как ферментация может увеличивать биологическую ценность34, снижать аллергенность35 белков и добавлять витамины36.
Наконец, микроорганизмы, создаваемые ими экзополисахариды, микробные строительные блоки, белки и метаболиты, вероятно, прямо или косвенно взаимодействуют с нашей физиологией, а также с микробиомом нашего кишечника, тем самым влияя на наше здоровье37. Хотя исследований на тему интервенций в человеческий рацион было сравнительно мало, большинство полученных данных свидетельствует о том, что потребление ферментированных продуктов полезно для здоровья, особенно в плане смягчения метаболических заболеваний и улучшения управления весом и настроением, а также снижения общей смертности37. В этом отношении представляет интерес недавнее исследование влияния, которое оказывает обогащение рациона ферментированными продуктами на воспаление кишечника и разнообразие кишечного микробиома у взрослых людей Запада38. Было отмечено, что диета, обогащённая ферментированными продуктами, уменьшает воспалительные сигналы и увеличивает разнообразие кишечного микробиома38. Чем объясняются эти положительные эффекты, ещё неясно, но определённую роль могут играть перемещение микробов из пищи в кишечник, поскольку микробы из ферментированных продуктов способны выжить в желудочно-кишечном тракте39, и взаимодействия, которые происходят между микробными пищевыми метаболитами, кишечным микробным сообществом и организмом хозяина. Достижения в области метагеномного секвенирования в сочетании с клиническими испытаниями должны улучшить наши знания о микробных и молекулярных взаимодействиях между ферментированными продуктами и человеческим организмом. В долгосрочной перспективе, если потребление ферментированных продуктов действительно может изменить и обогатить микробиом нашего кишечника, эти продукты могут сыграть важную роль в противодействии критической потере микробного биоразнообразия кишечника40 и связанному с этим ухудшению здоровья.
Микробное биоразнообразие как новый источник пищи
В ферментированных продуктах могут существовать разнообразные микробиомы; тем не менее, количество микроорганизмов, которые намеренно были добавлены в контролируемые человеком виды ферментации, остаётся весьма ограниченным. Хотя многие микроорганизмы, вероятно, не годятся на роль нашей пищи, изучение ареалов тех из них, которые потенциально съедобны, в сочетании с нашей растущей способностью культивировать их, а также генотипически и фенотипически характеризовать, обещает выявить новые метаболические возможности микробных пищевых продуктов, в том числе новые виды вкуса41, текстур, полезных для здоровья эффектов16 и положительно влияющих на питание микробов42 (Рис. 2). Как по применяемому подходу, так и по потенциальному воздействию этот «биологический поиск» новых полезных микробных штаммов может оказаться похожим на традиционный поиск по всему миру создаваемых различными микробами натуральных продуктов, увенчавшийся разработкой множества исключительно важных, глубоко повлиявших на нашу жизнь лекарств43.
Изучение микробного биоразнообразия позволяет выявить новые организмы, биомасса которых можно непосредственно потребляться. В прошлом столетии были предприняты огромные усилия для анализа пищевых профилей микроорганизмов с конечной целью производства биомассы для питания людей и животных50. Благодаря успехам в культивировании, в том числе в осуществлении подпитываемых процессов, в начале ХХ века стало возможным производить микробную биомассу из дешёвых потоков отходов в богатую белком биомассу51. Несмотря на крупномасштабные инвестиции в индустрию микробной биомассы и быструю окупаемость затрат51, с 1980-х годов на этом рынке осталась только одна компания. В то время как большинство компаний производило пищевые добавки, эта компания создала из экологического изолята нитчатого гриба Fusarium venenatum микопротеин, который имеет полный аминокислотный профиль, обладает мясными вкусом и текстурой и используется в ряде продуктов, имитирующих мясо52.
По прогнозам специалистов, производство микробной биомассы и её последующее внедрение в рацион человека окажут существенное положительное влияние на экологию. Созданная из сточных вод путём извлечения питательных веществ и анаэробного сбраживания микробная биомасса, если сравнивать её с говядиной, снижает на 96% негативное воздействие на климат, улучшает на 99% землепользование и снижает на 85% потребление пресной воды53. Вот почему сейчас многие компании вернулись к идее использовать микробную биомассу и осуществлять инновации с применением новых методов ферментации54 и организмов, включая альтернативы мясу, изготовляемые на основе съедобного штамма Fusarium из горячих источников Йеллоустона55, и новые альтернативы молоку, изготовляемые на основе изолята из человеческого кишечника с исключительно высоким содержанием белка42.
Мицелий съедобных базидиальных грибов также привлекает всё большее внимание при производстве продуктов питания56. Мицелиальные грибы известны прежде всего тем, что обладают богатым потенциалом для производства вкусных, питательных и естественно текстурированных продуктов, но, кроме того, своей способностью продуцировать биологически активные белки и метаболиты57. Возможно, что многие из этих естественных организмов обладают лечебными свойствами; например, известно, что ловастатин, содержащийся в шиитаке, снижает у людей уровень холестерина58. Съедобная плесень Monascus, которая является ключевым компонентом красного риса — традиционного ферментированного продукта, — также способна снижать уровень холестерина и используется в традиционной китайской медицине59. Вероятно, есть и другие, неизвестные нам штаммы, ожидающие, что их откроют и будут использовать в лечебных целях. Дополнительные исследования требуются, впрочем, не только для определения терапевтического потенциала биоактивных соединений мицелия, но и для оценки безопасности известных и новых штаммов мицелиальных грибов.
Широкий доступ к ресурсам биоразнообразия позволяет совершенствовать не только производство микробной биомассы, но и ферментацию пищевых продуктов, что показали дрожжи рода Lanchacea, выделенные из кишечника осы и успешно применённые в коммерческом пивоварении. Эти дрожжи, во-первых, растут быстрее обычных пивоваренных дрожжей, а во-вторых — дают восхитительный фруктовый вкус41,60.
Приведённые примеры красноречиво свидетельствуют о том, как важно выделять микроорганизмы из новых районов обитания, чтобы проверить их пригодность для производства продуктов питания (Рис. 2). Ожидается, что достижения в сфере глубокого метагеномного профилирования и методов культивирования в ближайшие годы сделают выявление новых микроорганизмов, пригодных для производства продуктов питания, ещё более стремительным.
Микробные пищевые продукты нового поколения на основе научно обоснованной ферментации и синтетической биологии
Научно обоснованная ферментация для устойчивого и здорового производства продуктов питания
Несмотря на кажущуюся точность и воспроизводимость многочисленных методов ферментации, многие из них были разработаны эмпирически, без глубокого понимания лежащей в их основе микробиологии61. Классифицируя виды ферментации, можно выделять «дикие»62,63 и инокулированные преднамеренно64. В первом случае микробы появляются из субстрата или из окружающей среды, во втором — вводятся как заквасочные культуры или добавляются из предыдущей партии ферментации (добавление барды предыдущего брожения). Эти различные методы в сочетании с человеческим влиянием на формирование условий ферментации путём выбора субстратов и регулирования доступности кислорода, концентрации соли и температуры используются для того, чтобы воздействовать на ферментирующие микробные сообщества.
Однако мы только сейчас начинаем понимать микробиологию и биохимию пищевой ферментации. Благодаря культивированию и секвенированию ДНК традиционных и новых ферментированных продуктов стало ясно, что ферментированные продукты обязаны своими качествами огромному биоразнообразию микроорганизмов. Традиционные ферментированные продукты часто содержат очень сложные, но при этом устойчивые сообщества микроорганизмов65, в отличие от современных заквасочных культур, которые обычно требуют поддерживать определённые условия роста. Следовательно, научное исследование ферментации должно учитывать сложность природных микробных сообществ, чтобы в будущем появились более надёжные закваски. Критическое значение для формирования вкуса, помимо разнообразия на уровне типов и видов, имеют штаммоспецифические вариации в ферментированных пищевых продуктах. Например, в ходе филогенетической кластеризации и геномного анализа 30 штаммов бактерии Streptococcus thermophilus, производящей йогурт, недавно обнаружены специфические мутации, связанные с повышенным производством уксусной кислоты и улучшением вкуса йогурта66.
По мере углубления наших знаний о ферментирующих микробных сообществах становится возможным разрабатывать более сложные и специализированные виды ферментации. Например, учёные изучили, как функционирование популярных овощных ферментов, содержащихся в квашеной капусте, кимчи и маринованных огурцах, связано с изменением с течением времени уровня кислотности67. Выбор определённой продолжительности ферментации может увеличить или определить уровень кислотности, влияя на вкус, срок годности и безопасность пищевых продуктов67. Ключевым параметром для управления процессом ферментации помимо времени является температура. Недавнее исследование, в ходе которого проводилось сравнение различных температур ферментации при производстве йогурта, показало, что для оптимизации питательной ценности йогурта лучше всего подходит температура 37°C (свободные аминокислоты, ненасыщенные жирные кислоты), а вкусовой профиль оптимален при 42°C, т. е. при обычной для промышленного изготовления йогурта температуре68. Чтобы модифицировать закваски, можно использовать не только условия ферментации, но и, к примеру, обогащение традиционных заквасок бактериями, способными синтезировать для повышения пищевой ценности продуктов витамин B1269.
До сих пор влияние различных заквасок и условий ферментации изучалось на отдельных ферментах и в скромных масштабах. Систематические исследования, база данных выявленных фактов и прогнозирование на основе искусственного интеллекта могли бы стать отличными инструментами для более лёгкого достижения при управлении процессами ферментации конкретных характеристик, таких как вкус, текстура, питательная ценность и оздоровительные эффекты (Рис. 2).
Улучшение натуральных пищевых микробиомов с помощью синтетической биологии
Выявление свойств микроорганизмов, оптимальных для производства пищевых продуктов, делает возможным улучшение этих характеристик. Одомашнивание70, адаптивная лабораторная эволюция71, селекция72 и скрининг естественной изменчивости73, а также случайный мутагенез в сочетании с селекцией74, являются общепризнанными методами, которые можно использовать для выявления штаммов с улучшенной функциональностью. Недавно сообщалось об успешном лабораторном одомашнивании для производства сыра нового вида Penicillium, что свидетельствует о пригодности данного подхода для улучшения или создания желаемых свойств микроорганизмов75.
Генная инженерия позволяет придавать микробным пищевым продуктам совершенно новые свойства. Недавно это было продемонстрировано на пивных дрожжах Saccharomyces cervisiae: для производства линалоола и гераниола, двух основных детерминантов вкуса в охмелённом пиве, учёные применили CRISPR-Cas9-инженерию76. Генетически модифицированные дрожжи позволяют обходиться без традиционно применяемого хмеля Humulus lupulus, экономя затраты пивоваров, снижая воздействие на окружающую среду77 и открывая новые возможности для точного контроля вкуса. Аналогичный подход к производству вкусовых компонентов может быть распространён на другие съедобные микробы для улучшения ферментации пищевых продуктов за счёт производства на месте ароматических и вкусовых соединений. Недавно оказались коммерчески привлекательными в качестве заменителей мяса на растительной основе создаваемые различными организмами гемоглобины. Их старт на данном поприще представляет значительный интерес, ибо их можно трансформировать в съедобную микробную биомассу или в ферменты на растительной основе78.
Удаление неприятных привкусов — ещё одна потенциальная область применения генной инженерии. Фотосинтезирующие цианобактерии питательны, растут на устойчивых ресурсах питательных веществ, однако из-за образования неприятных привкусов они пока что используются как микробная биомасса для производства продуктов питания весьма ограниченно79. Применяя высокопроизводительную культивацию и метаболомический скрининг, пути возникновения привкусов можно успешно выявлять, а затем полностью устранять80.
Кроме того, для решения глобальных проблем в продовольственной сфере генные инженеры обещают разработать программирование микробного содержания питательных веществ. Микробы будут конструироваться для увеличения содержания белка за счёт сверхэкспрессии ценных белков с идеальным балансом аминокислот81. Вдобавок, чтобы добиться высокой производительности, можно сверхэкспрессировать рационально сконструированные белки с оптимальными пищевыми профилями82. А ещё можно сконструировать микробы для производства таких питательных веществ, как предшественники каротиноидных витаминов83, которые в настоящее время предполагается использовать для создания микробного корма для рыб84 или для производства полезных для здоровья веществ и лекарств. Учёные, возможно, совместят конструирование пробиотиков для лечения заболеваний и предоставления полезных для здоровья добавок in situ в желудочно-кишечном тракте с разработкой новых продуктов питания85.
Вдобавок генная инженерия способна оказать помощь в воссоздании — по крайней мере частичном — таких неблагоприятно влияющих на экологию продуктов животного происхождения, как яйца и молочные продукты. Для этого нужно использовать микроорганизмы в качестве клеточных фабрик, где микробы генетически запрограммированы на перепроизводство белков или молекул, которые можно собирать из клеток или супернатантов в биореакторах86. Данный подход традиционно применяется по отношению к ферментам и пищевым ингредиентам87, но компании всё чаще прибегают к использованию этой технологии для производства заменителей экологически дорогостоящих продуктов, таких как молочные продукты, яичные белки и жиры. В настоящее время наиболее важными являются молочные белки, такие как казеины и сыворотка, которые производятся в различных микробных хозяевах88,89,90. Всё большее число компаний разрабатывает на основе этой технологии заменители молочных продуктов, и исходные продукты уже представлены на рынке США91. Использование синтетической биологии позволяет нам переосмыслить традиционные продукты животного происхождения, поскольку теперь можно контролировать точный питательный состав и рецептуру этих продуктов, чтобы разрабатывать продукты, специально адаптированные к нашим потребностям в питании и здоровье, а также к нашим кулинарным предпочтениям.
Устойчивые субстраты для производства микробных продуктов питания
Микроорганизмы играют решающую роль в круговороте питательных веществ во всех экосистемах Земли92. Частью этого круговорота является фиксация атмосферных газов, включая углекислый газ, метан и азот93,94,95, а также разложение органики96 и даже неорганики97. Метаболическую способность микроорганизмов расти на различных субстратах, включая метан, лигноцеллюлозу и углеводороды, можно использовать для того, чтобы сделать производство микробных пищевых продуктов ещё более устойчивым путём предоставления микробам возможности эффективно преобразовывать непищевые субстраты в человеческую пищу50,98.
В Индонезии потоки отходов используются в качестве субстрата для микробной ферментации на протяжении столетий. Здесь побочные продукты производства соевого молока (соевая пульпа, или окара) и арахисового масла (арахисовый жмых) инокулируются съедобным нитчатым грибом Neurospora intermedia для производства онкома — микробного пищевого продукта, который в местной кухне либо жарят, либо добавляют в тушёное мясо99. Приготовленный онком по вкусу напоминает мясной фарш и богат белком100. Даже без учёта ферментации производство микробных белков из потоков отходов и CO2 интенсивно изучается и уже используется в промышленности101. Развитие производства продуктов питания на основе таких потоков отходов может оказать существенное положительное влияние на общий выброс CO2 глобальной продовольственной системы12.
Многие широко распространённые потоки отходов, такие как пивная дробина, кукурузная солома, рисовые и пшеничные отруби, имеют благоприятный питательный состав с высоким содержанием клетчатки и белка102,103,104. Сами по себе эти потоки отходов нежелательны или недостаточно удобоваримы для человеческого желудка. Микробная ферментация питательных отходов может сделать питательные вещества более доступными, а также создать желаемую пищу. Помимо благоприятного влияния на устойчивость питания, такие богатые клетчаткой рационы, вероятно, окажут положительное воздействие и на здоровье человека, ибо клетчатка способствует увеличению микробного разнообразия кишечника и улучшению обмена веществ105.
Заглядывая вперёд
Ферментированные продукты, микробная биомасса и производимые микробами ингредиенты имеют долгую историю безопасного потребления и обладают огромным потенциалом для обеспечения устойчивого, сытного и вкусного питания растущего населения планеты. Включение микробных пищевых продуктов в наш рацион имеет огромный потенциал для радикального снижения воздействия на окружающую среду, поскольку 1 микробная биомасса оказывает меньшее воздействие на окружающую среду, чем некоторые традиционно выращиваемые культуры106; 2 пищевые отходы и другие источники углерода можно превращать во вкусную еду, повышая тем самым эффективность землепользования и сокращая отходы, а также выбросы углекислого газа107; и 3 пища, получаемая с помощью микробов, может полностью заменить экологически дорогостоящие пищевые продукты. Мало того, что микробные пищевые продукты оказывают весьма слабое воздействие на окружающую среду, — их, к тому же, можно массово производить из ограниченных ресурсов в биореакторах, т. е. независимо от климатических условий и природных катастроф, что позволит обеспечивать пищей уязвимые группы населения108. Наша способность совершенствовать синтез микробов и пищевых ингредиентов открывает широкий простор для создания персонализированных, питательно и здравоохранительно оптимизированных видов диеты.
В настоящее время в сфере создания пищевых продуктов мы наблюдаем потрясающий воображение взрыв инноваций, при этом ключевую роль играет промышленность. Некоторые компании, специализирующиеся на ферментации, предприняли попытки создать восхитительные варианты вкуса (например, проекты Noma109) и устойчивые альтернативы мясу (например, MATR Foods110, Mediterranean Food Lab111). В таких компаниях, как MyForest food112, исследуют натурально текстурированную микробную биомассу, получаемую в результате твёрдофазной ферментации. На основе микробной биомассы, создаваемой из глубинной культуры, удалось разработать производство различных заменителей мяса (например, Quorn113, Mycorena114). Новые подходы, предположительно с использованием поверхностной ферментации на жидких субстратах, изучаются, например, в компании Aqua Cultured Foods115, чтобы создать альтернативу цельным морепродуктам. Помимо заменителей мяса, генерируются микробные белковые порошки, например, за счёт улавливания углерода (Air Protein116, Solar Foods101). Сходным образом, для замены растительных масел могут использоваться выделенные из микробной биомассы липиды, что продемонстрировала, например, компания Zero Acre Farms117, а компании Melt&Marble118 и Nourish Ingredients119 производят рекомбинантные животные жиры. Другие рекомбинантные продукты из клеточных фабрик — это кисломолочные продукты, которые производит растущий ряд компаний, в частности Perfect Day91 и Remilk120.
Однако реализация потенциала микробных пищевых продуктов в больших масштабах потребует решения крупных проблем разного уровня.
Во-первых, следует тщательно оценить воздействие этих продуктов на устойчивость питания, чтобы определить, являются ли они более выгодными в данном отношении, чем существующие альтернативы. Это создаст фундамент для обоснования инвестиций в крупномасштабную инфраструктуру, разработку продуктов и маркетинг.
Во-вторых, микробные пищевые продукты должны быть питательными и безопасными для употребления, а также иметь привлекательный вкус, текстуру и внешний вид, чтобы конкурировать с продуктами, представленными на рынке в настоящее время. Хотя провести анализ питательной ценности пищи нетрудно, количественная оценка безопасности и органолептических свойств пищи до сих пор далека от идеала. Многие микроорганизмы продуцируют вторичные метаболиты, большинство из которых не охарактеризовано. Между тем, некоторые метаболиты могут оказаться токсичными. Для выяснения степени безопасности определённых микробных пищевых продуктов важно разработать быстрые и надёжные тесты на производство микробами токсинов. Вдобавок, чтобы исключить токсические или аллергенные эффекты, следует тщательно тестировать на безопасность и микробную биомассу. При этом нам необходимо разработать систему простого и эффективного мониторинга долгосрочных последствий использования микробной биомассы в нашем рационе. Более того, органолептические свойства обычно оцениваются в рамках органолептического анализа или путём количественных измерений с помощью метаболомических или текстурных анализаторов. Органолептический анализ имеет качественный характер и зависит от ряда личных и ситуационных факторов, а количественные измерения очень трудно переводить на язык реальных ощущений. Следовательно, нам потребуется разработать новую систему, способную интегрировать количественные и качественные данные для оценки и описания пищевых продуктов.
В-третьих, микробиом и влияние нашего рациона на здоровье нуждаются в дополнительном изучении в рамках клинических исследований на тему интервенций в питание, а также в рамках фундаментальной молекулярной биологии, позволяющей выявить конкретные механизмы. Впоследствии, опираясь на полученные данные, необходимо соответствующим образом обновить рекомендации по питанию.
В-четвёртых, устойчивая продовольственная система должна быть равноправной, справедливой и повсеместно доступной. Многие традиционные процессы ферментации были разработаны или всё ещё практикуются на Глобальном Юге121. Хотя наука может дополнительно оптимизировать эти методы для получения новых устойчивых продуктов питания, нам необходимо подумать о том, как отдать должное богатым традиционным знаниям. Кроме того, будущие разработки микробных пищевых продуктов должны учитывать технологическую доступность и возможность производства в различных контекстах. В то время как традиционные методы ферментации развивались в местных условиях и хорошо адаптированы к местным материалам и климатическим условиям, современное микробное производство продуктов питания, включая получение биомассы и ферментацию с использованием определённых заквасочных культур, обычно осуществляется крупномасштабно, промышленно, в строго контролируемых условиях. В будущем для производства микробных пищевых продуктов в больших количествах потребуется разработать более технологичные решения, внедрение и эксплуатацию которых можно будет осуществлять везде.
Наконец, хотя, по прогнозам, развитие производства новых микробных пищевых продуктов зависит, в основном, от генной инженерии, широкое внедрение этих продуктов встречает на своём пути серьёзные преграды в виде существующих во многих частях мира ограничительных норм и скептицизма потребителей в отношении генетически модифицированных организмов. Если данные проблемы будут решены, микробные пищевые продукты могут радикально изменить нашу продовольственную систему уже в ближайшие годы.
Благодарности
Работа была поддержана грантом NNF NNF20CC0035580 Фонда Ново Нордиск (Novo Nordisk Foundation), Институтом хорошей еды (Good Food Institute), а также стипендией Института Миллера (Miller Institute) для фундаментальных научных исследований.
- Willett W., Rockström J., Loken B., Springmann M., Lang T., Vermeulen S., Garnett T., Tilman D., DeClerck F., Wood A., et al.
Food in the Anthropocene: the EAT—Lancet Commission on healthy diets from sustainable food systems.
Lancet.2019; 393: 447-492
https://doi.org/10.1016/S0140-6736(18)31788-4 - Zurek M., Hebinck A., Selomane O.
Climate change and the urgency to transform food systems.
Science.2022; 376: 1416-1421
https://doi.org/10.1126/science.abo2364 - Caldeira C., De Laurentiis V., Corrado S.Коррадо С., van Holsteijn F., Sala S.
Quantification of food waste per product group along the food supply chain in the European Union: a mass flow analysis.
Resour. Conserv. Recycl. 2019; 149: 479-488
https://doi.org/10.1016/j.resconrec.2019.06.011 - Wolf C., Ripple W.J., Crist E.
Human population, social justice, and climate policy.
Sustain. Sci. 2021; 16: 1753-1756
https://doi.org/10.1007/s11625-021-00951-w - Chen X., Zhang Z., Yang H., Qiu P., Wang H., Wang F., Zhao Q., Fang J., Nie J.
Consumption of ultra-processed foods and health outcomes: a systematic review of epidemiological studies.
Nutr. J. 2020; 19: 86
https://doi.org/10.1186/s12937-020-00604-1 - Mohamed H.I., Sofy M.R., Almoneafy A.A., Abdelhamid M.T., Basit A., Sofy A.R., Lone R., Abou-El-Enain M.M.
Role of microorganisms in managing soil fertility and plant nutrition in sustainable agriculture.
in: Mohamed H.I. El-Beltagi H.E.-D.S. Abd-Elsalam K.A. Plant Growth-Promoting Microbes for Sustainable Biotic and Abiotic Stress Management. Springer International Publishing, 2021: 93-114
https://doi.org/10.1007/978-3-030-66587-6_4 - Todeschini V., AitLahmidi N., Mazzucco E., Marsano F., Gosetti F., Robotti E., Bona E., Massa N., Bonneau L., Marengo E., et al.
Impact of beneficial microorganisms on strawberry growth, fruit production, nutritional quality, and volatilome.
Front. Plant Sci. 2018; 9: 1611 - Schaeffer R.N., Mei Y.Z., Andicoechea J., Manson J.S., Irwin R.E.
Consequences of a nectar yeast for pollinator preference and performance.
Funct. Ecol. 2017; 31: 613-621
https://doi.org/10.1111/1365-2435.12762 - Amato K.R., Mallott E.K., D’Almeida Maia P., Savo Sardaro M.L.
Predigestion as an evolutionary impetus for human use of fermented food.
Curr. Anthropol. 2021; 62: S207-S219
https://doi.org/10.1086/715238 - Alexander M., Turnbaugh P.J.
Deconstructing mechanisms of diet-microbiome-immune interactions.
Immunity. 2020; 53: 264-276
https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.07.015 - Mazac R., Meinilä J., Korkalo L., Järviö N., Jalava M., Tuomisto H.L.
Incorporation of novel foods in European diets can reduce global warming potential, water use and land use by over 80%.
Nat. Food. 2022; 3: 286-293
https://doi.org/10.1038/s43016-022-00489-9 - Humpenöder F., Bodirsky B.L., Weindl I., Lotze-Campen H., Linder T., Popp A.
Projected environmental benefits of replacing beef with microbial protein.
Nature. 2022; 605: 90-96
https://doi.org/10.1038/s41586-022-04629-w - Marco M.L., Sanders M.E., Gänzle M., Arrieta M.C., Cotter P.D., De Vuyst L., Hill C., Holzapfel W., Lebeer S. Merenstein D., et al.
The International Scientific Association for Probiotics and Prebiotics (ISAPP) consensus statement on fermented foods.
Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2021; 18: 196-208
https://doi.org/10.1038/s41575-020-00390-5 - Boethius A.
Something rotten in Scandinavia: the world’s earliest evidence of fermentation.
J. Archaeol. Sci. 2016; 66: 169-180
https://doi.org/10.1016/j.jas.2016.01.008 - Perruchini E., Glatz C., Hald M.M., Casana J., Toney J.L.
Revealing invisible brews: a new approach to the chemical identification of ancient beer.
J. Archaeol. Sci. 2018; 100: 176-190
https://doi.org/10.1016/j.jas.2018.05.010 - Jeong C., Wilkin S., Amgalantugs T., Bouwman A.S., Taylor W.T.T., Hagan R.W., Bromage S., Tsolmon S., Trachsel C., Grossmann J.,et al.
Bronze age population dynamics and the rise of dairy pastoralism on the eastern Eurasian steppe.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2018; 115: E11248-E11255
https://doi.org/10.1073/pnas.1813608115 - Bryant K., Hansen C., Hecht E.
Fermentation technology as a driver of human brain expansion.
2020
https://doi.org/10.20944/preprints202010.0135.v1 - Amato K.R., Chaves Ó.M., Mallott E.K., Eppley T.M., Abreu F., Baden A.L., Barnett A.A., Bicca-Marques J.C., Boyle S.A., Campbell C.J.,et al.
Fermented food consumption in wild nonhuman primates and its ecological drivers.
Am. J. Phys. Anthropol. 2021; 175: 513-530
https://doi.org/10.1002/ajpa.24257 - Breslin P.A.S.
An evolutionary perspective on food and human taste.
Curr. Biol. 2013; 23: R409-R418
https://doi.org/10.1016/j.cub.2013.04.010 - Peters A., Krumbholz P., Jäger E., Heintz-Buschart A., Çakir M.V., Rothemund S., Gaudl A., Ceglarek U., Schöneberg T., Stäubert C.
Metabolites of lactic acid bacteria present in fermented foods are highly potent agonists of human hydroxycarboxylic acid receptor 3.
PLoS Genet. 2019; 15: e1008145
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008145 - Campbell-Platt G.
Fermented foods—a world perspective.
Food Res. Int. 1994; 27: 253-257
https://doi.org/10.1016/0963-9969(94)90093-0 - Simango C., Rukure G.
Survival of bacterial enteric pathogens in traditional fermented foods.
J. Appl. Bacteriol. 1992; 73: 37-40
https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.1992.tb04966.x - Siedler S., Rau M.H., Bidstrup S., Vento J.M., Aunsbjerg S.D., Bosma E.F., McNair L.M., Beisel C.L., Neves A.R.
Competitive exclusion is a major bioprotective mechanism of lactobacilli against fungal spoilage in fermented milk products.
Appl. Environ. Microbiol. 2020; 86: e02312-19
https://doi.org/10.1128/AEM.02312-19 - Adebayo C.O., Aderiye B.I.
Antifungal activity of bacteriocins of lactic acid bacteria from some Nigerian fermented foods.
Res. J. Microbiol. 2010; 5: 1070-1082 - Cleveland J., Montville T.J., Nes I.F., Chikindas M.L.
Bacteriocins: safe, natural antimicrobials for food preservation.
Int. J. Food Microbiol. 2001; 71: 1-20
https://doi.org/10.1016/S0168-1605(01)00560-8 - Adams M.R.
Why Fermented Foods Can Be Safe.
in: Adams M.R. Robert Nout M.J. Fermentation and Food Safety. Aspen Publishers, Inc, 2001: 39-52 - Park M.K., Kim Y.-S.
Mass spectrometry based metabolomics approach on the elucidation of volatile metabolites formation in fermented foods: a mini review.
Food Sci. Biotechnol. 2021; 30: 881-890
https://doi.org/10.1007/s10068-021-00917-9 - Chen P.-J., Antonelli M.
Conceptual models of food choice: influential factors related to foods, individual differences, and society.
Foods. 2020; 9: 1898
https://doi.org/10.3390/foods9121898 - Anaemene D., Fadupin G.
Anti-nutrient reduction and nutrient retention capacity of fermentation, germination and combined germination-fermentation in legume processing.
Appl. Food Res. 2022; 2: 100059
https://doi.org/10.1016/j.afres.2022.100059 - Neylon E., Arendt E.K., Zannini E., Sahin A.W.
Fermentation as a tool to revitalise brewers’ spent grain and elevate techno-functional properties and nutritional value in high fibre bread.
Foods. 2021; 10: 1639
https://doi.org/10.3390/foods10071639 - Reddy N.R., Pierson M.D.
Reduction in antinutritional and toxic components in plant foods by fermentation.
Food Res. Int. 1994; 27: 281-290
https://doi.org/10.1016/0963-9969(94)90096-5 - Padmaja G., Steinkraus K.H.
Cyanide detoxification in cassava for food and feed uses.
Crit. Rev. Food Sci. Nutr. 1995; 35: 299-339
https://doi.org/10.1080/10408399509527703 - Kobawila S.C., Louembe D., Keleke S., Hounhouigan J., Gamba C.
Reduction of the cyanide content during fermentation of cassava roots and leaves to produce bikedi and ntoba mbodi, two food products from Congo.
Afr. J. Biotechnol. 2005; 4: 689-696
https://doi.org/10.4314/ajb.v4i7.15168 - Adebo J.A., Njobeh P.B., Gbashi S., Oyedeji A.B., Ogundele O.M., Oyeyinka S.A., Adebo O.A.
Fermentation of cereals and legumes: impact on nutritional constituents and nutrient bioavailability.
Fermentation. 2022; 8: 63
https://doi.org/10.3390/fermentation8020063 - El Mecherfi K.E., Todorov S.D., Cavalcanti de Albuquerque M.A., Denery-Papini S., Lupi R., Haertlé T., Dora Gombossy de Melo Franco B., Larré C.
Allergenicity of fermented foods: emphasis on seeds protein-based products.
Foods. 2020; 9: 792
https://doi.org/10.3390/foods9060792 - Liem I.T., Steinkraus K.H., Cronk T.C.
Production of vitamin B-12 in tempeh, a fermented soybean food.
Appl. Environ. Microbiol. 1977; 34: 773-776
https://doi.org/10.1128/aem.34.6.773-776.1977 - Leeuwendaal N.K., Stanton C., O’Toole P.W., Beresford T.P.
Fermented foods, health and the gut microbiome.
Nutrients. 2022; 14: 1527
https://doi.org/10.3390/nu14071527 - Wastyk H.C., Fragiadakis G.K., Perelman D., Dahan D., Merrill B.D., Yu F.B., Topf M., Gonzalez C.G., Van Treuren W., Han S., et al.
Gut-microbiota-targeted diets modulate human immune status.
Cell. 2021; 184 (4137.e14—4153.e14)
https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.06.019 - Haller D., Colbus H., Gänzle M.G., Scherenbacher P., Bode C., Hammes W.P.
Metabolic and functional properties of lactic acid bacteria in the gastro-intestinal ecosystem: a comparative in vitro study between bacteria of intestinal and fermented food origin.
Syst. Appl. Microbiol. 2001; 24: 218-226
https://doi.org/10.1078/0723-2020-00023 - Sonnenburg E.D., Sonnenburg J.L.
The ancestral and industrialized gut microbiota and implications for human health.
Nat. Rev. Microbiol. 2019; 17: 383-390
https://doi.org/10.1038/s41579-019-0191-8 - Madden A.A., Epps M.J., Fukami T., Irwin R.E., Sheppard J., Sorger D.M., Dunn R.R.
The ecology of insect—yeast relationships and its relevance to human industry.
Proc. Biol. Sci. 2018; 285: 20172733
https://doi.org/10.1098/rspb.2017.2733 - Green Queen
Superbrewed: U.S. startup launches animal-free dairy with herbivore-inspired microbe protein.
https://www.greenqueen.com.hk/superbrewed-u-s-startup-launches-animal-free-dairy-with-herbivore-inspired-microbe-protein/
Date: 2021 - Ziemert N., Alanjary M., Weber T.
The evolution of genome mining in microbes—a review.
Nat. Prod. Rep. 2016; 33: 988-1005
https://doi.org/10.1039/C6NP00025H - Wu B., Hussain M., Zhang W., Stadler M., Liu X., Xiang M.
Current insights into fungal species diversity and perspective on naming the environmental DNA sequences of fungi.
Mycology. 2019; 10: 127-140
https://doi.org/10.1080/21501203.2019.1614106 - Louca S., Mazel F., Doebeli M., Parfrey L.W.
A census-based estimate of Earth’s bacterial and archaeal diversity.
PLoS Biol. 2019; 17: e3000106
https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3000106 - Dykhuizen D.
Species numbers in bacteria.
Proc. Calif. Acad. Sci. 2005; 56: 62-71 - Hyde K.D.
The numbers of fungi.
Fungal Divers. 2022; 114: 1
https://doi.org/10.1007/s13225-022-00507-y - Kalac P.
Edible Mushrooms.
First Edition. Academic Press, 2016
https://www.elsevier.com/books/edible-mushrooms/kalac/978-0-12-804455-1 - Parente E., Zotta T., Ricciardi A.
FoodMicrobionet v4: a large, integrated, open and transparent database for food bacterial communities.
Int. J. Food Microbiol. 2022; 372: 109696
https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2022.109696 - Tannenbaum S.R., Wang D.I.C.
Single-Cell Protein II.
MIT Press, 1975 - Goldberg I.
Single Cell Protein.
Springer Science & Business Media, 2013 - Sadler M.
QUORN.
Nutr. Food Sci. 1988; 88: 9-11
https://doi.org/10.1108/eb059180 - Durkin A., Finnigan T., Johnson R., Kazer J., Yu J., Stuckey D., Guo M.
Can closed-loop microbial protein provide sustainable protein security against the hunger pandemic?.
Curr. Res. Biotechnol. 2022; 4: 365-376
https://doi.org/10.1016/j.crbiot.2022.09.001 - Vandelook S., Elsacker E., Van Wylick A., De Laet L., Peeters E.
Current state and future prospects of pure mycelium materials.
Fungal Biol. Biotechnol. 2021; 8: 20
https://doi.org/10.1186/s40694-021-00128-1 - Wackett L.P.
Microbial meat substitutes: an annotated selection of World Wide Web sites relevant to the topics in microbial biotechnology.
Microb. Biotechnol. 2020; 13: 1284-1285
https://doi.org/10.1111/1751-7915.13610 - Berger R.G., Bordewick S., Krahe N.-K., Ersoy F.
Mycelium vs. fruiting bodies of edible fungi—a comparison of metabolites.
Microorganisms. 2022; 10: 1379
https://doi.org/10.3390/microorganisms10071379 - Bhambri A., Srivastava M., Mahale V.G., Mahale S., Karn S.K.
Mushrooms as potential sources of active metabolites and medicines.
Front. Microbiol. 2022; 13: 837266 - Lo Y.-C., Lin S.-Y., Ulziijargal E., Chen S.-Y., Chien R.-C., Tzou Y.-J., Mau J.-L.
Comparative study of contents of several bioactive components in fruiting bodies and mycelia of culinary-medicinal mushrooms.
Int. J. Med. Mushrooms. 2012; 14: 357-363
https://doi.org/10.1615/IntJMedMushr.v14.i4.30 - Lin C.-C., Li T.-C., Lai M.-M.
Efficacy and safety of Monascus purpureus Went rice in subjects with hyperlipidemia.
Eur. J. Endocrinol. 2005; 153: 679-686
https://doi.org/10.1530/eje.1.02012 - Wasp Beer Lachancea LLC
Wasp beer & bumblebee beer.
https://lachancea.com/wasp-beer1 - Leech J., Cabrera-Rubio R., Walsh A.M., Macori G., Walsh C.J., Barton W., Finnegan L., Crispie F., O’Sullivan O., Claesson M.J.,Cotter P.D.
Fermented-food metagenomics reveals substrate-associated differences in taxonomy and health-associated and antibiotic resistance determinants.
mSystems. 2020; 5: e00522-20
https://doi.org/10.1128/mSystems.00522-20 - Miller E.R., Kearns P.J., Niccum B.A., O’Mara Schwartz J., Ornstein A., Wolfe B.E.
Establishment limitation constrains the abundance of lactic acid bacteria in the napa cabbage phyllosphere.
Appl. Environ. Microbiol. 2019; 85: e00269-19
https://doi.org/10.1128/AEM.00269-19 - Criste A., Copolovici L., Copolovici D., Kovacs M., Madden R.H., Corcionivoschi N., Gundogdu O., Berchez M., Urcan A.C.
Determination of changes in the microbial and chemical composition of Țaga cheese during maturation.
PLoS One. 2020; 15: e0242824
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0242824 - Landis E.A., Oliverio A.M., McKenney E.A., Nichols L.M., Kfoury N., Biango-Daniels M., Shell L.K., Madden A.A., Shapiro L., Sakunala S., et al.
The diversity and function of sourdough starter microbiomes.
eLife. 2021; 10: e61644
https://doi.org/10.7554/eLife.61644 - Blasche S., Kim Y., Mars R.A.T., Machado D., Maansson M., Kafkia E., Milanese A., Zeller G., Teusink B., Nielsen J., et al.
Metabolic cooperation and spatiotemporal niche partitioning in a kefir microbial community.
Nat. Microbiol. 2021; 6: 196-208
https://doi.org/10.1038/s41564-020-00816-5 - Liu W., Su X., Duo N., Yu J., Song Y., Sun T., Zha M., Menghe B., Zhang H., Sun Z.
A survey of the relationship between functional genes and acetaldehyde production characteristics in Streptococcus thermophilus by multilocus sequence typing.
J. Dairy Sci. 2019; 102: 9651-9662
https://doi.org/10.3168/jds.2018-16203 - Pérez-Díaz I.M.
Fermented vegetables as vectors for relocation of microbial diversity from the environment to the human gut.
in: Azcarate-Peril M.A. Arnold R.R. Bruno-Bárcena J.M. How Fermented Foods Feed a Healthy Gut Microbiota: a Nutrition Continuum. Springer International Publishing, 2019: 91-123
https://doi.org/10.1007/978-3-030-28737-5_4 - Yang S., Yan D., Zou Y., Mu D., Li X., Shi H., Luo X., Yang M., Yue X., Wu R., Wu J.
Fermentation temperature affects yogurt quality: a metabolomics study.
Food Biosci. 2021; 42: 101104
https://doi.org/10.1016/j.fbio.2021.101104 - Wang Y., Xie C., Pulkkinen M., Edelmann M., Chamlagain B., Coda R., Sandell M., Piironen V., Maina N.H., Katina K.
In situ production of vitamin B12 and dextran in soya flour and rice bran: a tool to improve flavour and texture of B12-fortified bread.
LWT. 2022; 161: 113407
https://doi.org/10.1016/j.lwt.2022.113407 - Gallone B., Steensels J., Prahl T., Soriaga L., Saels V., Herrera-Malaver B., Merlevede A., Roncoroni M., Voordeckers K., Miraglia L., et al.
Domestication and divergence of Saccharomyces cerevisiae Beer yeasts.
Cell. 2016; 166 (1397.e16—1410.e16)
https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.08.020 - Sandberg T.E., Salazar M.J., Weng L.L., Palsson B.O., Feist A.M.
The emergence of adaptive laboratory evolution as an efficient tool for biological discovery and industrial biotechnology.
Metab. Eng. 2019; 56: 1-16
https://doi.org/10.1016/j.ymben.2019.08.004 - Marullo P., Bely M., Masneuf-Pomarède I., Pons M., Aigle M., Dubourdieu D.
Breeding strategies for combining fermentative qualities and reducing off-flavor production in a wine yeast model.
FEMS Yeast Res. 2006; 6: 268-279
https://doi.org/10.1111/j.1567-1364.2006.00034.x - Steensels J., Snoek T., Meersman E., Picca Nicolino M.P., Voordeckers K., Verstrepen K.J.
Improving industrial yeast strains: exploiting natural and artificial diversity.
FEMS Microbiol. Rev. 2014; 38: 947-995
https://doi.org/10.1111/1574-6976.12073 - Aleem B., Rashid M.H., Zeb N., Saqib A., Ihsan A., Iqbal M., Ali H.
Random mutagenesis of super Koji (Aspergillus oryzae): improvement in production and thermal stability of α-amylases for maltose syrup production.
BMC Microbiol. 2018; 18: 200
https://doi.org/10.1186/s12866-018-1345-y - Bodinaku I., Shaffer J., Connors A.B., Steenwyk J.L., Biango-Daniels M.N., Kastman E.K., Rokas A., Robbat A., Wolfe B.E.
Rapid phenotypic and metabolomic domestication of wild penicillium molds on cheese.
mBio. 2019; 10: e02445-19
https://doi.org/10.1128/mBio.02445-19 - Denby C.M., Li R.A., Vu V.T., Costello Z., Lin W., Chan L.J.G., Williams J., Donaldson B., Bamforth C.W., Petzold C.J., et al.
Industrial brewing yeast engineered for the production of primary flavor determinants in hopped beer.
Nat. Commun. 2018; 9: 965
https://doi.org/10.1038/s41467-018-03293-x - Steinhaus M., Schieberle P.
Comparison of the most odor-active compounds in fresh and dried hop cones (Humulus lupulus L. variety spalter select) based on GC−olfactometry and odor dilution techniques.
J. Agric. Food Chem. 2000; 48: 1776-1783
https://doi.org/10.1021/jf990514l - Fraser R.Z., Shitut M., Agrawal P., Mendes O., Klapholz S.
Safety evaluation of soy leghemoglobin protein preparation derived from pichia pastoris, intended for use as a flavor catalyst in plant-based meat.
Int. J. Toxicol. 2018; 37: 241-262
https://doi.org/10.1177/1091581818766318 - Cuellar-Bermúdez S.P., Barba-Davila B., Serna-Saldivar S.O., Parra-Saldivar R., Rodriguez-Rodriguez J., Morales-Davila S., Goiris K., Muylaert K., Chuck-Hernández C.
Deodorization of Arthrospira platensis biomass for further scale-up food applications.
J. Sci. Food Agric. 2017; 97: 5123-5130
https://doi.org/10.1002/jsfa.8391 - Rubin B.E., Huynh T.N., Welkie D.G., Diamond S., Simkovsky R., Pierce E.C., Taton A., Lowe L.C., Lee J.J., Rifkin S.A., et al.
High-throughput interaction screens illuminate the role of c-di-AMP in cyanobacterial nighttime survival.
PLS Genet. 2018; 14: e1007301
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007301 - Spalvins K., Raita S., Valters K., Blumberga D.
Improving single cell protein yields and amino acid profile via mutagenesis: review of applicable amino acid inhibitors for mutant selection.
Agronomy Research. 2021; 19: 1285-1307
https://doi.org/10.15159/ar.21.083 - Bartolo-Aguilar Y., Chávez-Cabrera C., Cancino-Díaz J.C., Marsch R.
Expression of a synthetic protein with a high proportion of essential amino acids by Pichia pastoris.
Rev. Mex. Ing. Quím. 2021; 20: Bio2419
https://doi.org/10.24275/rmiq/Bio2419 - Misawa N., Shimada H.
Metabolic engineering for the production of carotenoids in non-carotenogenic bacteria and yeasts.
J. Biotechnol. 1997; 59: 169-181
https://doi.org/10.1016/s0168-1656(97)00154-5 - KnipBio
Enabling sustainable aquaculture KnipBio.
https://www.knipbio.com - Riglar D.T., Silver P.A.
Engineering bacteria for diagnostic and therapeutic applications.
Nat. Rev. Microbiol. 2018; 16: 214-225
https://doi.org/10.1038/nrmicro.2017.172 - SECRETERS — European Union’s Horizon 2020 Programme
Microbial protein cell factories fight back?.
Trends Biotechnol. 2022; 40: 576-590
https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2021.10.003 - Silveira B.M.P., Barcelos M.C.S., Vespermann K.A.C., Pelissari F.M., Molina G.
An overview of biotechnological processes in the food industry.
in: Bioprocessing for Biomolecules Production. John Wiley & Sons, Ltd, 2019: 1-19
https://doi.org/10.1002/9781119434436.ch1 - Rocha T.L., Paterson G., Crimmins K., Boyd A., Sawyer L., Fothergill-Gilmore L.A.
Expression and secretion of recombinant ovine β-lactoglobulin in Saccharomyces cerevisiae and Kluyveromyces lactis.
Biochem. J. 1996; 313: 927-932
https://doi.org/10.1042/bj3130927 - Wang Y., Kubiczek D., Horlamus F., Raber H.F., Hennecke T., Einfalt D., Henkel M., Hausmann R., Wittgens A., Rosenau F.
Bioconversion of lignocellulosic ‘waste’ to high-value food proteins: recombinant production of bovine and human αS1-casein based on wheat straw lignocellulose.
GCB Bioenergy. 2021; 13: 640-655
https://doi.org/10.1111/gcbb.12791 - Kang Y.C., Richardson T.
Molecular cloning and expression of bovine κ-casein in Escherichia coli.
J. Dairy Sci. 1988; 71: 29-40
https://doi.org/10.3168/jds.S0022-0302(88)79521-1 - Perfect Day
We’re rethinking everything. Starting with food. A kinder, greener protein designed for a sustainable future.
2022
https://perfectday.com/ - Soong J.L., Fuchslueger L., Marañon-Jimenez S., Torn M.S., Janssens I.A., Penuelas J., Richter A.
Microbial carbon limitation: the need for integrating microorganisms into our understanding of ecosystem carbon cycling.
Glob. Change Biol. 2019; 26: 1953-1961
https://doi.org/10.1111/gcb.14962 - Stewart W.D.P.
Nitrogen fixation by photosynthetic microorganisms.
Annu. Rev. Microbiol. 1973; 27: 283-316
https://doi.org/10.1146/annurev.mi.27.100173.001435 - Tabita F.R.
Molecular and cellular regulation of autotrophic carbon dioxide fixation in microorganisms.
Microbiol. Rev. 1988; 52: 155-189 - Higgins I.J., Best D.J., Hammond R.C., Scott D.
Methane-oxidizing microorganisms.
Microbiol. Rev. 1981; 45: 556-590 - Kothe E.
Microbial degradation.
in: Reitner J. Thiel V. Encyclopedia of Geobiology Encyclopedia Of Earth Sciences Series. Springer, 2011: 596-599
https://doi.org/10.1007/978-1-4020-9212-1_141 - Esser K., Lemke P.A., Bennett J.W.
The Mycota: a Comprehensive Treatise on Fungi as Experimental Systems for Basic and Applied Research.
Springer-Verlag, 1994 - Fernández-Fueyo E., Ruiz-Dueñas F.J., Martínez M.J., Romero A., Hammel K.E., Medrano F.J., Martínez A.T.
Ligninolytic peroxidase genes in the oyster mushroom genome: heterologous expression, molecular structure, catalytic and stability properties, and lignin-degrading ability.
Biotechnol. Biofuels. 2014; 7: 2
https://doi.org/10.1186/1754-6834-7-2 - Andayani S.N., Lioe H.N., Wijaya C.H., Ogawa M.
Umami fractions obtained from water-soluble extracts of red oncom and black oncom—Indonesian fermented soybean and peanut products.
J. Food Sci. 2020; 85: 657-665
https://doi.org/10.1111/1750-3841.14942 - Quinn M.R., Beuchat L.R., Miller J., Young C.T., Worthington R.E.
Fungal fermentation of peanut flour: effects on chemical composition and nutritive value.
J. Food Sci. 1975; 40: 470-474
https://doi.org/10.1111/j.1365-2621.1975.tb12507.x - Solar Foods
Food out of thin air.
https://solarfoods.fi/ - Ikram S., Huang L., Zhang H., Wang J., Yin M.
Composition and nutrient value proposition of brewers spent grain.
J. Food Sci. 2017; 82: 2232-2242
https://doi.org/10.1111/1750-3841.13794 - Mourtzinis S., Cantrell K.B., Arriaga F.J., Balkcom K.S., Novak J.M., Frederick J.R., Karlen D.L.
Carbohydrate and nutrient composition of corn stover from three southeastern USA locations.
Biomass Bioenergy. 2016; 85: 153-158
https://doi.org/10.1016/j.biombioe.2015.11.031 - Onipe O.O., Jideani A.I.O., Beswa D.
Composition and functionality of wheat bran and its application in some cereal food products.
Int. J. Food Sci. Technol. 2015; 50: 2509-2518
https://doi.org/10.1111/ijfs.12935 - Jefferson A., Adolphus K.
The effects of intact cereal grain fibers, including wheat bran on the gut microbiota composition of healthy adults: a systematic review.
Front. Nutr. 2019; 6: 33 - Leger D., Matassa S., Noor E., Shepon A., Milo R., Bar-Even A.
Photovoltaic-driven microbial protein production can use land and sunlight more efficiently than conventional crops.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2021; 118 (e2015025118)
https://doi.org/10.1073/pnas.2015025118 - Upcraft T., Tu W.-C., Johnson R., Finnigan T., Van Hung N.V., Hallett J., Guo M.
Protein from renewable resources: mycoprotein production from agricultural residues.
Green Chem. 2021; 23: 5150-5165
https://doi.org/10.1039/D1GC01021B - García Martínez J.B., Egbejimba J., Throup J., Matassa S., Pearce J.M., Denkenberger D.C.
Potential of microbial protein from hydrogen for preventing mass starvation in catastrophic scenarios.
Sustain. Prod. Consum. 2021; 25: 234-247
https://doi.org/10.1016/j.spc.2020.08.011 - Noma Projects
From the Noma Kitchen To Yours.
Smoked mushroom garum. 2022;
https://nomaprojects.com/ - Forside MATR Foods
A new generation of plant food.
2022
https://matrfoods.com/en/ - The Mediterranean Food Lab Med Food Lab
2022
https://www.med-food-lab.com - MyFOREST FOODS
2022
https://myforestfoods.com - Vegetarian
Vegan Products Meat Free Recipes & News Quorn.
2022
https://www.quorn.dk/ - Mycorena
Fungi-based alternative protein for the food industry.
2022
https://mycorena.com/ - Aqua Cultured Foods — Sustainable Seafood alternatives Aqua Cult
2022
https://www.aquaculturedfoods.com - Air Protein
Meat made from air.
2022
https://www.airprotein.com - Zero Acre Farms
Meet Cultured Oil. 2022
https://www.zeroacre.com/ - Melt&Marble|Precision fermentation for designer fats|Västra Götalands län Melt&Marble
2022
https://www.meltandmarble.com - Home Nourish Ingred
Fats, the future of food.
2022
https://nourishing.io/ - Remilk: Real Dairy. No Cows. (2022) We recreated dairy that makes our world a better place.
https://www.remilk.com/ - Obafemi Y.D., Oranusi S.U., Ajanaku K.O., Akinduti P.A., Leech J.,Cotter P.D.
African fermented foods: overview, emerging benefits, and novel approaches to microbiome profiling.
NPJ Sci. Food. 2022; 6: 15
https://doi.org/10.1038/s41538-022-00130-w