Новости из Денисовой пещеры: в полку прибыло. На самом деле, о 4-м денисовце сообщалось уже давно, а о сути исследования рассказывали на конференции Европейского общества по изучению эволюции человека осенью 2015 года. Но статьи пишутся не быстро. Наконец, опубликованы результаты анализа митохондриальной и ядерной ДНК Денисова 2 (такой номер присвоили зубу, найденному в пещере ещё в 1984 году). До этого, исследованы были геномы Денисова 3 (фаланга мизинца) и двух коренных зубов — Денисова 4 и Денисова 8.
Собственно, благодаря Денисова 3, обнаруженной в 2008 году, мир узнал о денисовцах. Поскольку в том же месте нашли и неандертальские останки (в частности, фалангу стопы, по геному которой описана «алтайская ветвь» неандертальцев), пещера была «коммунальной квартирой», которую населяли разные виды людей. Загадочные гоминины из Денисовой пещеры — либо их близкие родственники — оставили след в родословной современных жителей островов Юго-Восточной Азии и Океании, и в меньшей степени в геномах популяций Азии и Америки.
Кстати, недавно фрагменты денисовской ДНК удалось выделить прямо из отложений пещеры, причём более древних, чем человеческие останки.
Теперь палеогенетики взялись за извлечение генетической информации из невзрачного молочного зуба, более 30 лет ждавшего своего часа. Этот сильно стёртый второй моляр был обнаружен в слое 22.1 главной галереи пещеры. Зуб сохранился так плохо, что установить, к какому виду он относился, не представлялось возможным — специалисты только предположили, что он принадлежал ребёнку 10-12 лет и отметили очень крупные размеры — типичные для неандертальцев.
ДНК выделили из образца весом 10 мг. Сначала авторы статьи приводят анализ митохондриальной ДНК, которая оказалась близка другим денисовцам. Специалисты установили, что девочка Денисова 2 отличается от Денисова 8 29 нуклеотидными заменами, 70 замен отделяют её от Денисова 4 и 72 — от Денисова 3. Ещё интересней, что от последнего общего предка 4х денисовцев новый индивид отличается всего 9 нуклеотидными заменами (для сравнения, Денисова 8 имеет отличия от общего предка в 20 позициях). Таким образом, новоиспечённый член денисовской семьи оказывается самым древним. Но насколько он древнее остальных?
Используя метод молекулярных часов, выяснили, что новый денисовец старше «Денисова 8» (самой древней из оставшихся 3х индивидов) на 21 — 38 тыс. лет. От «Денисова 3» и «Денисова 4» (примерно синхронных) находку отделяет уже 54-99 тыс. лет. Конечно, авторы уточняют, что скорость мутирования ДНК денисовцев могла отличаться от современной. Но Денисова 2 в любом случае оказывается древнейшим денисовцем из известных науке.
Затем генетики взялись за ядерную ДНК, которая, к сожалению, сохранилась не слишком хорошо — удалось расшифровать только 47 мегабаз (из 3 тысяч). Это затрудняет анализ и не даёт возможности выявить обмен генами между денисовцами и ещё кем-нибудь (что получилось в случае генома Денисова 3). Тем не менее, генетики, посчитав соотношение между полученными фрагментами Х-хромосомы и аутосом, пришли к выводу, что Денисова 2 была женского пола. Ещё одна девочка!
Наконец, авторы исследования оценили генетическое разнообразие денисовских людей в 4,3 — 5,9% (это доля продвинутых — отличных от шимпанзе — позиций в ДНК, по которым денисовцы различаются между собой). Для неандертальцев, чьи геномы известны, аналогичная цифра составила 2,6 — 4,2%, и для 12 современных людей из разных частей света — 5,1 — 9,2 %. Так что разнообразие денисовцев находится на «нижней границе разнообразия современных людей» (логично, учитывая, что все находки происходят из одной пещеры).
А каков же абсолютный возраст зуба Денисова 2? Слой 22.1 ещё в конце прошлого века был датирован методом радиотермолюминесценции, и получилось 128 — 227 тыс. лет (хотя эти даты подвергались сомнению). Датировка «Денисова 3» молекулярно-генетическими методами дала возраст 48-60 тыс. лет. Если Денисова 2 жила на 50 — 100 тыс. лет древнее, чем Денисова 3, это попадает в диапазон дат, полученный ранее. В любом случае получается, что новоиспечённая «денисовка» жила как минимум 100 тыс. лет назад. А это, по мысли авторов, делает Денисова 2 «древнейшим известным гоминидом в Центральной Азии». Тут можно, правда, вспомнить, архаичную черепную крышку Салхит из Монголии, но у неё нет датировок.
Главный вывод: денисовцы жили на Алтае до-о-олго, наверняка встречались с неандертальцами и смешивались с ними.
Всё о Денисовой пещере на АНТРОПОГЕНЕЗ.РУ.