Синтия 3.0: меньше генов, больше информации об их работе

JCVI-syn3.0 (Изображение: Tom Deerinck and Mark Ellisman of the National Center for Imaging and Microscopy Research at the University of California at San Diego).

Джон Крейг Вентер (John Craig Venter) и коллектив его института продолжают совершенствовать синтетическую бактерию. Спроектирован и создан организм с рекордно коротким генетическим кодом. Статья об этом опубликована в журнале Science.

Первый синтетический одноклеточный организм, «Синтия» (Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0), был создан в 2010 году. У первой Синтии генетический код состоял из 1,08 миллиона пар оснований и 901 гена, у третьей — 531 560 пар оснований и всего 473 гена.

Работа коллектива Джона Вентера имеет цель определить тот минимальный объём генетической информации, которой достаточно для существования простейшего живого организма. Это необходимо для изучения функций генов, работа над этой задачей ещё далека от завершения — у Синтии 3.0 есть 149 генов, роль которых неизвестна, но вместе с тем важна, их удаление приводит к тому, что бактерия оказывается нежизнеспособной.

«Наша попытка проектирования и создания новых видов, в конечном счёте, успешная, показала, что функция 32% генов, необходимых для жизни этой клетки, неизвестна, и видно, что многие из них устойчивы и обнаруживаются у многих видов. Все исследования в области биоинформатики в последние 20 лет недооценивали ряд важных генов, сосредоточившись только на уже известных. Это та важная роль, которую играют наши исследования в деле изучения человеческого генома», — говорит Джон Вентер.

Команда Вентера смогла определить биологические функции большинства генов Синтии. 41% отвечает за экспрессию генов, 18% относится к строению и работе клеточной мембраны, 17% связаны с цитозольным метаболизмом и 7% — с сохранением информации о геноме. 149 генов пока не соотносятся с определённой биологической функцией, несмотря на интенсивные исследования. Это то, что ещё предстоит изучить. Конечный итог проекта — синтетический организм с полностью понятным генетическим кодом.

Сергей Сыров :